DNA測(cè)序(DNA sequencing,或譯DNA定序)是指利用一定的實(shí)驗(yàn)室方法分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥(niǎo)嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測(cè)序方法的出現(xiàn)極大地推動(dòng)了生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的研究和發(fā)現(xiàn)。
DNA測(cè)序有助于了解人類基因組、其他動(dòng)物、植物和微生物的完整DNA序列,為進(jìn)一步研究和改造目的基因提供了科學(xué)基礎(chǔ),極大地推動(dòng)了生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的研究及發(fā)現(xiàn),近幾年來(lái)已經(jīng)被快速應(yīng)用在眾多領(lǐng)域,如疾病診斷、微生物鑒定、法醫(yī)生物學(xué)、生物技術(shù)、生物系統(tǒng)學(xué)等。
生成互相獨(dú)立的若干組帶放射性標(biāo)記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點(diǎn),但卻隨機(jī)終止于特定的一種或者多種殘基上。 由于DNA上的每一個(gè)堿基出現(xiàn)在可變終止端的機(jī)會(huì)均等,因此上述每一組產(chǎn)物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長(zhǎng)度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。 在可以區(qū)分長(zhǎng)度僅差一個(gè)核苷酸的不同DNA分子的條件下,對(duì)各組寡核苷酸進(jìn)行電泳分析,只要把幾組寡核苷酸加樣于測(cè)序凝膠中若干個(gè)相鄰的泳道上,即可從凝膠的放射自影片上直接讀出DNA上的核苷酸順序。
由于二級(jí)結(jié)構(gòu)或者其它內(nèi)在因素的影響,復(fù)雜結(jié)構(gòu)對(duì)于測(cè)序是巨大的挑戰(zhàn)。常規(guī)的測(cè)序方案往往容易出現(xiàn)提前中斷或者測(cè)序結(jié)果紊亂的現(xiàn)象。
以下幾種序列特點(diǎn)的樣品適合針對(duì)復(fù)雜結(jié)構(gòu)的測(cè)序方案:
高GC含量:GC含量>60%的模板,或者局部高GC含量的模板
發(fā)夾結(jié)構(gòu):包含兩個(gè)反向重復(fù)序列,兩個(gè)重復(fù)序列之間間隔至少3個(gè)堿基
重復(fù)序列:2個(gè)或3個(gè)堿基的多個(gè)連續(xù)重復(fù)。
DNA發(fā)卡結(jié)構(gòu)及RNAi 模板測(cè)序
RNA干擾(RNAi)是指雙鏈RNA(dsRNA)介導(dǎo)的特異性抑制某相關(guān)基因表達(dá)的一種機(jī)制。它逐漸發(fā)展為一種研究基因功能的快速有效的新興技術(shù)。
RNAi模板,由于其存在 “發(fā)卡結(jié)構(gòu)”,給測(cè)序工作帶來(lái)了很大挑戰(zhàn)。在RNAi研究中采用的小發(fā)卡RNA(shRNA)通常無(wú)法測(cè)序成功,測(cè)序結(jié)果往往提前中斷或者信號(hào)紊亂。三羊開(kāi)肽擁有專門針對(duì)shRNA模板的測(cè)序方案,測(cè)序結(jié)果得到客戶的一致認(rèn)可。
三羊開(kāi)肽的測(cè)序方案可以對(duì)環(huán)狀基因組的噬菌體(噬菌體上清或者噬菌斑)直接測(cè)序。當(dāng)難以獲得足夠量的測(cè)序用噬菌體DNA樣品時(shí),該操作為您省掉DNA制備的繁瑣過(guò)程,并能獲得高質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果。
本項(xiàng)服務(wù)包括:
·節(jié)約時(shí)間和成本-無(wú)需菌液培養(yǎng)和DNA制備
·ABI3730xl DNA序列分析儀進(jìn)行序列分析
·Phred20有效長(zhǎng)度大于600bp
·免費(fèi)提供三羊開(kāi)肽通用引物
·您可以選擇在線提交訂單,三羊開(kāi)肽CLIMS系統(tǒng)將長(zhǎng)期保存您的訂單信息以及測(cè)序結(jié)果:
·三羊開(kāi)肽的技術(shù)支持會(huì)針對(duì)項(xiàng)目中的問(wèn)題及時(shí)與您溝通
三羊開(kāi)肽可以通過(guò)Primer Walking測(cè)序,幫助您獲得未知克隆的序列信息,或者驗(yàn)證克隆序列的準(zhǔn)確性。如果您提供參考序列,我們可以一次完成長(zhǎng)片段克隆的全長(zhǎng)測(cè)序。
·引物設(shè)計(jì)并合成
·根據(jù)序列圖譜進(jìn)行人工編輯
·序列拼接
·發(fā)送拼接序列結(jié)果
1、專業(yè)的測(cè)序設(shè)備,保證大量樣品的快速測(cè)序
2、復(fù)雜結(jié)構(gòu)的最佳測(cè)序方案
3、免費(fèi)的通用引物
4、專業(yè)的技術(shù)支持